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Ubantu 18.04安装gromacs2021最后一步报错,全过程展示

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发布时间: 2024-9-4 17:05

正文摘要:

各位大佬,我在ubantu上安装gmx,在最后一步编译make install 时报错。下面,我把全部的过程进行展示,请佬们指点迷津。 一、安装cmake 3.29 本机上已经有cmake 3.10,但是版本太低了,需要升级为高版本的。 (1 ...

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znjnancy 发表于 Post on 2024-10-29 18:14:26
15939474177 发表于 2024-10-20 12:15
大佬,想问下就是原本是2018版本的,若是安装2019版本,需要把原来2018版本的卸载吗?还是说直接安装2019 ...

不用卸载2018的, 只需要在bashrc环境中改成新的gmx版本的路径就行了
15939474177 发表于 Post on 2024-10-20 12:15:56
znjnancy 发表于 2024-9-4 20:10
安装成功了,喜极而泣

重新安装gmx

大佬,想问下就是原本是2018版本的,若是安装2019版本,需要把原来2018版本的卸载吗?还是说直接安装2019的版本呢
znjnancy 发表于 Post on 2024-9-4 20:10:38
安装成功了,喜极而泣

重新安装gmx
解压后进入目录
cd gromacs-2021
mkdir build
cd build
export CMAKE_PREFIX_PATH=/实际路径/fftw338
cmake .. -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/实际路径/gmx2021 -DCMAKE_C_COMPILER=/usr/bin/gcc -DCMAKE_CXX_COMPILER=/usr/bin/g++
make install -j
在bashrc中添加:source /实际路径/gmx2021/bin/GMXRC

去gromacs上官网上参考了安装的教程后解决的https://manual.gromacs.org/docum ... index.html#compiler
t675210552 发表于 Post on 2024-9-4 17:17:59
可能是你gcc g++版本与此版本gromacs不相匹配

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