将分子分割成片段进行构象搜索的问题

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发布时间: 2024-9-6 14:37

请教大家一个问题：实验室有一个标记物（类似间三联苯，即三个平面，并且H原子的位阻也比较相似），标记在核糖的C1'上；我们要对该标记物建立Rotamer library（实际上，就是对分子进行系统式搜索）；该体 ...

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sobereva 发表于 Post on 2024-9-6 16:44:49

没具体结构没法准确回答
能分片段处理的前提是被旋转的部分之间的耦合足够小（不同二面角下它们的相互作用的差异不会对整体能量有严重影响）

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