计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

用gauss view画二聚体后用高斯16正常优化完,振子强度很小是什么原因呀?

查看数: 382 | 评论数: 5 | 收藏 Add to favorites 0
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
wgl
发布时间: 2024-9-10 09:58

正文摘要:

想求助一下,最近想分析二聚体的荧光特性,先是优化单体,用优化好的单体构型在gauss view里面画二聚体分子,生成的.gjf文件,用高斯16进行结构优化,任务正常结束,但是为啥振子强度特别小啊?不知道是哪一步出现了 ...

回复 Reply

WYY@ 发表于 Post on 2024-9-11 11:33:17
本帖最后由 WYY@ 于 2024-9-11 11:41 编辑

如果是单体用优化完的结构算的S1的振子强度小呢?也是因为结构不合理吗?还是说方法和泛函什么的选的不对啊

202409111141138123..png (40.74 KB, 下载次数 Times of downloads: 1)

202409111141138123..png
cokie 发表于 Post on 2024-9-10 22:18:55
wgl 发表于 2024-9-10 17:21
你好,感谢解答,这个分子是实验中已经合成的分子,实验中观测到在水溶液中有AIE(聚集诱导发光)现象, ...

水中AIE的话,常规文献通常选择两种模式来搭建聚集体的模型。
第一种是养单晶,然后从单晶中抠出一个团簇来进行后续的模拟计算。(可以看看sob老师这篇博文,大概了解一下如何选择合适的簇模型http://sobereva.com/597
第二种是通过跑分子动力学,模拟出一个分子聚集体,然后从中选取合适的团簇进行后续处理。

但无论哪种方法,对于普通AIE分子,发光大都只体现单分子发光的特征,你当前做的这种模拟,并不适合传统AIE分子。
wgl 发表于 Post on 2024-9-10 17:21:34
cokie 发表于 2024-9-10 16:12
不合理的地方太多了(大概从优化完单体之后的操作都不太合理),可以先搜搜excimer/exciplex发光的文章了解 ...

你好,感谢解答,这个分子是实验中已经合成的分子,实验中观测到在水溶液中有AIE(聚集诱导发光)现象,想通过理论计算的方式解释一下,看了不少文献都是通过算二聚体的方式来反映聚集态,看了sob老师关于构象搜索的帖子,现在通过molclus软件确定的初始构型,想问一下改用wb97xd泛函6-31g(d,p)基组合适吗?
cokie 发表于 Post on 2024-9-10 16:12:46
不合理的地方太多了(大概从优化完单体之后的操作都不太合理),可以先搜搜excimer/exciplex发光的文章了解一下,有几点建议也许可以供你参考。

i> 首先分子可扭转部分较多,结构很“崎岖”,因此直觉上,在分散相里,大概率分子间很难形成excimer/exciplex,不知道是如何判断分子存在“二聚体发光”,一般这个发光峰会相较单体红移+structureless
ii> 如果该双分子发光是在分散相里观测到的,那么最好用构象搜索的方法来确定二聚体构象;如果该双分子发光是在凝聚相里观测到的,那么最好以晶体中二聚体的结构作为初始构型做QM/MM计算。
iii> 一般激基复合物发光都有电子转移特征,所以用B3LYP算出的发光无论是振子强度还是波长都不准,建议范围分离或者w调控的泛函或者双杂化泛函。
wgl 发表于 Post on 2024-9-10 09:59:18
log文件太大了,放不上去,放的截图

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 23:36 , Processed in 0.190578 second(s), 26 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list