计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

新人求助关于晶体中截取片段几何优化后出现一个虚频的解决办法

查看数: 165 | 评论数: 2 | 收藏 Add to favorites 0
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2024-9-11 10:27

正文摘要:

本帖最后由 chenwujia 于 2024-9-11 10:29 编辑 各位老师好,我的初始晶体结构如图所示,是两根链接并且平行排列的磷链(单质磷),我从中截取了部分片段进行高斯的结构优化。 第一次我没有设置对称性,分子以C1 ...

回复 Reply

chenwujia 发表于 Post on 2024-9-11 13:22:12
sobereva 发表于 2024-9-11 12:28
完全不知道你的实际目的是什么
大概率根本就不该用Gaussian来算,而应当用CP2K等当成周期性体系来算
而且 ...

sob老师您好!
非常感谢您的回复!
我是想通过截取初始晶体中的若干可能得中间体片段,给出潜在的晶体生长过程中的中间结构与能量变化。
在我的体系里面,由于中间体片段是孤立的,不太适用于周期性的计算软件。(此前我有想过在三个方向上加真空层再用cp2k去计算,但感觉孤立体系还是高斯合适一点)
由于我这个是从晶体中截取的孤立片段,在边界不饱和磷原子处我是加氢去饱和。此前我试过加DFT-D3校正,但是由于氢键作用会导致结构扭曲。
sobereva 发表于 Post on 2024-9-11 12:28:26
完全不知道你的实际目的是什么
大概率根本就不该用Gaussian来算,而应当用CP2K等当成周期性体系来算
而且毫无理由用描述分子间相互作用颇烂的PBE,至少也应该用B3LYP-D3(BJ)。仔细看
谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正?”
http://sobereva.com/413
牵扯到分子间相互作用而且体系又小,起码应该用6-311G*或def-TZVP优化


手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 23:50 , Processed in 0.218292 second(s), 26 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list