计算完打开过后的chk文件，感觉结构明显不对，且偶极矩结果也不对

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发布时间: 2024-9-21 15:28

各位老师好!这是我计算完打开过后的chk文件，感觉结构明显不对，且偶极矩结果也不对，不知道时什么原因导致的。

回复 Reply

zzm666 发表于 Post on 2024-9-21 22:11:44

谢谢几位老师感谢

pikachuupup 发表于 Post on 2024-9-21 21:22:05

zzm666 发表于 2024-9-21 21:04
老师就是这样的，是有什么问题吗？我不会从高斯建立3D带点模型，还请老师指教

楼上正解

zh7729 发表于 Post on 2024-9-21 21:10:34

zzm666 发表于 2024-9-21 21:04
老师就是这样的，是有什么问题吗？我不会从高斯建立3D带点模型，还请老师指教

你这个是质子化的氨基，氨基应该是-NH2，你把charge设置为2就好了

zzm666 发表于 Post on 2024-9-21 21:01:35

pikachuupup 发表于 2024-9-21 17:18
这个体系不可能是0价，是不是应该为两个氨基？

是的，两个氨基个带一个正电荷，我是从chemdraw3d导入的，不知道为什么不行。

zzm666 发表于 Post on 2024-9-21 21:00:51

pikachuupup 发表于 2024-9-21 17:18
这个体系不可能是0价，是不是应该为两个氨基？

是的，两个氨基个带一个正电荷，我是从chemdraw3d导入的，不知道为什么不行。

pikachuupup 发表于 Post on 2024-9-21 17:18:06

zzm666 发表于 2024-9-21 16:13
这个压缩包里面包含chk和out文件

这个体系不可能是0价，是不是应该为两个氨基？

zh7729 发表于 Post on 2024-9-21 17:09:46

zzm666 发表于 2024-9-21 16:13
这个压缩包里面包含chk和out文件

这个体系应该带电吧电荷设错了应该是把电荷设成2可以跑完且结果正常

zzm666 发表于 Post on 2024-9-21 16:13:19

m-pda.zip (1.92 MB, 下载次数 Times of downloads: 2) 这个压缩包里面包含chk和out文件

1.71 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

1.39 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

pikachuupup 发表于 Post on 2024-9-21 15:49:54

应该上传输入输出文件

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