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关于Merz离子力场参数的使用求助

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Layman

发布时间: 2024-9-21 16:46

正文摘要:

本帖最后由 Layman 于 2024-9-21 16:54 编辑各位老师，请问一下，我想做盐水结冰的模拟，在merz力场参数用于gromacs中，sob老师给出了转换公式（图片在论坛中sob老师的回答中获得），得到了σ=Rmin /（2的6分之 ...

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1Physics 发表于 Post on 2025-6-4 16:46:10

大佬您好，冒昧打扰我是新手小白有些问题想请教您，目前我在尝试用lammps去跑opc水模型，现在想加入钠离子和氯离子即3M的NaCl溶液，但是在根据这篇文献中的HEF参数集（https://dx.doi.org/10.1021/acs.jcim.0c01390
J.Chem. Inf.Model.2021,61,869−880）去设置pair_coeff，具体数值如下
pair_coeff 1 1 0.21280115 3.16655
pair_coeff 3 1 0.02960343 2.61390
pair_coeff 4 1 0.67878870 4.20504，其中类型1为o 类型2为h 类型3为Na 类型4为Cl，但是跑出来dump轨迹不是很合理，是哪里出问题了呀

zhubaonian 发表于 Post on 2025-2-22 16:24:48

本帖最后由 zhubaonian 于 2025-2-22 16:40 编辑

牧生发表于 2024-9-21 18:05
http://bbs.keinsci.com/thread-29974-1-1.html

非常有用

Layman 发表于 Post on 2024-9-21 18:10:11

牧生发表于 2024-9-21 18:05
http://bbs.keinsci.com/thread-29974-1-1.html

很有帮助，谢谢大佬

牧生 发表于 Post on 2024-9-21 18:05:25

本帖最后由牧生于 2024-9-21 18:15 编辑

http://bbs.keinsci.com/thread-29974-1-1.html

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