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求助g_MMPBSA计算ΔG结果报错

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发布时间: 2024-9-21 20:41

正文摘要:

在基于gmx的分子动力学模拟MD结果出来后,想计算Estimated Inhibition Constant (µM), 我查到这个值的计算公式为Ki = e^{-ΔG/ (RT)},目前只有ΔG[Gibbs Free Energy]还没有算出 我查到可以用g_MMPBSA进行计算 ...

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艾尔斯灿 发表于 Post on 2024-9-22 20:31:02
有没有大佬来教教我啊
艾尔斯灿 发表于 Post on 2024-9-22 13:23:38
Loading0760 发表于 2024-9-22 00:15
ABCDEF.top的文件中重复出现了两次ABC的拓扑,一次是在文件中写了,一次三在后面include引用。尝试删掉一个 ...

我删去了
#include "ABC.top"
可惜还是不行,提示并没有变,一样的报错
Loading0760 发表于 Post on 2024-9-22 00:15:35
ABCDEF.top的文件中重复出现了两次ABC的拓扑,一次是在文件中写了,一次三在后面include引用。尝试删掉一个。

  1. ; Include molecules
  2. #include "ABC.top"
  3. #include "DEF.itp"
复制代码


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