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gromacs里editconf在设置盒子大小时，可以规定盒子的体积吗？

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发布时间: 2024-9-22 15:08

正文摘要:

本帖最后由 Willow0114 于 2024-9-22 15:12 编辑我想要承接上一个模拟的pdb文件（里面有蛋白质和钙离子），继续添加新的离子然后跑gromacs，但是我在加盒子的时候，发现盒子的体积和之前不一样了（原因是，模拟 ...

回复 Reply

Willow0114 发表于 Post on 2024-9-23 09:34:04

非常感谢

Seyilaxa 发表于 Post on 2024-9-22 17:04:10

可以用genion直接在上一次模拟产生的.gro中加离子，不需要再设一次盒子

Lance先生 发表于 Post on 2024-9-22 15:47:15

能固定盒子大小，但是NPT之后盒子还是会变

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