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氢原子转移反应的过渡态IRC跑三个点就结束了求助

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发布时间: 2024-9-25 08:30

正文摘要:

如图所示,计算的是羟自由基进攻葡萄糖1号碳上的氢发生氢原子转移反应的过渡态。首先采用ub3lyp/6-31+g(d,p) scrf=(pcm,solvent=water) opt=modredundant进行羟基的氧原子与葡萄糖1号碳上的氢原子进行键角柔性扫描, ...

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ChengZi00 发表于 Post on 2024-9-27 03:12:59
sobereva 发表于 2024-9-25 22:08
该说的都说了
在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题
http://sobereva.com/400(http://bbs.keinsci.com/t ...

谢谢sob老师!
sobereva 发表于 Post on 2024-9-25 22:08:41
该说的都说了
在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题
http://sobereva.com/400http://bbs.keinsci.com/thread-7736-1-1.html
明确说了,opt和IRC的积分格点设置必须严格一致
另外,牵扯到分子内弱相互作用,最好加上D3
谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正?”
http://sobereva.com/413

对于加大步长,可以进一步测试30。SCF不收敛该怎么解决怎么解决
解决SCF不收敛问题的方法
http://sobereva.com/61
乐平 发表于 Post on 2024-9-25 09:33:23
羟自由基进攻葡萄糖1号碳上的氢发生氢原子转移反应的过渡态


你的目标是让葡萄糖1号碳上的氢和 OH 生成 H2O 分子吗?
如果是,那么从你贴的第3张图来看,过渡态可能还没找到,1号碳上 C-H 之间的距离可能还太近,OH 上的 O 和 1号碳上的 H 之间的距离还太远。

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