teller3531 发表于 2017-1-6 15:07 谢谢您的建议 |
qczgzly 发表于 2017-1-6 17:39 谢谢您 |
ssp2493187 发表于 2017-1-9 11:04 你把光标在图上移动一下,看看状态栏里是否显示了不同位置静电势的不同数值,如果是的话,说明静电势计算对了,但可能色彩刻度设置不合理没显示出颜色差异,你再调调色彩刻度。 |
ssp2493187 发表于 2017-1-9 09:56 什么叫negative没有了?截个图 |
本帖最后由 ssp2493187 于 2017-1-9 10:11 编辑 sobereva 发表于 2017-1-7 21:44 sob老师,cube文件我现在是得到了,但是我发现我在用GV进行投影的时候静电势的图只有一种颜色,但是按照我这个帖子进行的小分子测试时没有问题的,确确实实做出来了,按理来说即使是Mutiwfn或者其他方式得到cube文件都应该没问题啊(我用cubegen做的),那么出现这种问题的原因应该是什么呢?(这个分子是个600多个原子组成的双层酞菁衍生物),谢谢sob老师 |
sobereva 发表于 2017-1-7 21:44 明白了,谢谢sobereva老师 |
ssp2493187 发表于 2017-1-7 16:45 对于电子密度,multiwfn算不动的情况cubegen一定算不动,对于十几核的服务器,cubegen会慢一个数量级以上。不是精准与否的问题,电子密度计算精准度都一样。 |
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我的分子600多个原子使用了各种方法,我的个人PC用Mutiwfn做这个分子的计算也是很吃力,带不动的,本着解决问题的思路找了个比较麻烦但是能解决燃眉之急的方案,当然我个人还是觉得把分子放在服务器中做Mutiwfn分析应该更快更精准吧,不过我在起步学习这个Mutiwfn,练习明白了再抛弃cubegen吧,哈哈 |
sobereva 发表于 2017-1-6 20:02 谢谢sobereva老师的建议 |
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Multiwfn串行计算电子密度的速度都比cubegen快很多,更不必提并行情况了,Multiwfn甩cubegen几条街,cubegen算电子密度都不支持并行 multiwfn设定格点比cubegen灵活得多,操作也更方便,根本不需要记忆命令行 除非算大体系静电势cube文件,否则cubegen和Multiwfn比根本没有丝毫存在意义 |
| 可以在Linux图形界面上使用Linux版gview观看格点文件产生的轮廓图,毫无压力~ |
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大分子用Mutiwfn是不是更方便,我算过150个原子的分子还是很快的 且功能比gview更全面。 |
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