减小盒子,温度至少2000K |
既然是液体的那这盒子也太空,跟蒸汽也差不多了。跑好久才有效碰撞一次,完了角度不对没反应又撞远了。 建议是上AIMD之前先用reaxff跑一遍,至少能快速排除一些关于模型大小之类的非势函数问题。反正一把也就几分钟。 |
本帖最后由 牧生 于 2024-10-15 08:17 编辑 丁越 发表于 2024-10-14 23:25 我的想法是:这三物质都是液体,所以应该既是反应物,也是溶剂,不用额外加溶剂。势垒的问题,我尝试下再升高温度。 我试过PBE方法,用丙酮做隐式溶剂,算的太慢。 我会考虑下您的建议。 |
本帖最后由 丁越 于 2024-10-14 23:31 编辑 除非势垒很低的反应,跑个几十个ps有期望观察到化学反应的发生。这种势垒不低情况下一般都用一些动力学增强采样手段如Metadynamics, umbrella sampling等通过定义合理的反应坐标,然后研究沿着反应坐标的自由能变化。 另外还有一个问题是关于你的模型,这应该是液相反应吧,所以盒子里也得填充水,并且直接用NPT系综就行。 |
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