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关于在绘制表面静电势图时静电势电荷的选择问题

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tsgyls

发布时间: 2024-10-20 11:42

正文摘要:

本意是想要绘制如文献所示的分子表面静电势分布图，因为该结构包含有阳离子，所以参照http://sobereva.com/196一文中的方法，对分子进定量分子表面分析，得到极大值与极小值作为刻度极值目前的问题在对分 ...

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sobereva 发表于 Post on 2024-12-10 03:41:40

tsgyls 发表于 2024-12-9 16:42
sob老师，我按照您之前说的做了VMD的表面着色图。现在我需要补充一个数据计算极值点，用于比较多个类似的 ...

可

tsgyls 发表于 Post on 2024-12-9 16:42:51

本帖最后由 tsgyls 于 2024-12-9 20:16 编辑

sobereva 发表于 2024-10-20 13:12
直接按下文做就完了，完全不牵扯到原子电荷的事，这个体系也没多大，毫无必要基于原子电荷近似计算表面静电 ...

sob老师，我按照您之前说的做了VMD的表面着色图。现在我需要补充一个数据计算极值点，用于比较多个类似的结构中电荷的分布。那我想了解这种结构直接用该流程可以吗？还是说需要换一种电荷？

sobereva 发表于 Post on 2024-10-20 13:12:33

直接按下文做就完了，完全不牵扯到原子电荷的事，这个体系也没多大，毫无必要基于原子电荷近似计算表面静电势
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图（含视频演示）
http://sobereva.com/443（http://bbs.keinsci.com/thread-11080-1-1.html）

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