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求助分子轨道绘制问题

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发布时间: 2024-10-26 20:17

正文摘要:

本帖最后由 小白努力学习 于 2024-10-26 20:18 编辑 求救各位老师一个问题:我想自己绘制分子轨道,目前利用Gaussian转换的fch文件读取参数进行组合,原始高斯基函数用的是下面图片的公式。但是绘制的和GaussView ...

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wzkchem5 发表于 Post on 2024-10-27 14:45:30
小白努力学习 发表于 2024-10-27 03:24
老师有需求需要自己写一个可视化程序。我是读取fch的Primitive exponents ,Contraction coefficients , ...

是不是只作了轨道值>0的等值面,没有作轨道值<0的等值面?
我以前写过一个开源的轨道可视化程序http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 1&fromuid=21811,可以参考一下
小白努力学习 发表于 Post on 2024-10-27 10:24:29
sobereva 发表于 2024-10-26 23:00
描述得太不具体,没法说

开源免费的Multiwfn是看分子轨道非常好用的程序

老师有需求需要自己写一个可视化程序。我是读取fch的Primitive exponents ,Contraction coefficients ,P(S=P) Contraction coefficients ,Alpha MO coefficients  。
按照fch文件的数据顺序进行原子轨道组合,组合出的原子轨道数目和fch文件的也对应上了。首先归一化球谐函数的高斯函数,后带入X,Y,Z格点的数据,计算R,THETA,PHI,带入归一化后的高斯函数进行计算,组合原子轨道,在带入分子轨道系数组合分子轨道。但是P轨道的可视化一直是错误的,是一个半球形,无法和GaussView对应上。老师您看有哪些地方可能会出现问题的地方吗,麻烦您了
sobereva 发表于 Post on 2024-10-26 23:00:48
描述得太不具体,没法说

开源免费的Multiwfn是看分子轨道非常好用的程序
使用Multiwfn观看分子轨道
http://sobereva.com/269http://bbs.keinsci.com/thread-462-1-1.html

可以看Multiwfn的function.f90里的function fmo函数了解轨道波函数是怎么计算的。Multiwfn主页的Resources页面里有Modifying source code of Multiwfn幻灯片可以帮助了解Multiwfn的数据结构。载入fch获取波函数信息的方式可参看Multiwfn的fileIO.f90里的subroutine readfch以及下文
高斯fch文件与wfn波函数文件的介绍及转换方法
http://sobereva.com/55

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