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四配位Zn配合物结构优化过程中结构乱成一团

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发布时间: 2024-10-28 21:24

正文摘要:

这是优化过程中的图片,中心金属那里非常乱,求大佬指点一下这是什么原因造成的

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imasen 发表于 Post on 2024-10-31 11:36:01
本帖最后由 imasen 于 2024-10-31 11:43 编辑

加上隐式溶剂,并给泛函加上D3校正,如果计算出来还是这样的,说明当前结构下,质子在亚胺上才是合理的质子化配置。用GFN2-xTB级别跑了一下,确实是在亚胺上的。

截取优化后的部分片段,酚O与锌离子结合后本来结合质子能力就会降低,质子在亚胺上能与酚O和肟的N形成更稳定的双重氢键,所以这个结论是没啥问题的。
ionexchangeC 发表于 Post on 2024-10-29 21:42:20
我在想,如果你对锌原子用了个诸如cc-pVQZ-pp之类的赝势基组,但是你还是把genecp写出gen,能不能正常结束任务并且保持住基本正常的结构呢?然后你就发现不了这个错误了。
sobereva 发表于 Post on 2024-10-28 23:31:41
gen改成genecp
6-31g(d)后头别写个莫名其妙的0
snljty2 发表于 Post on 2024-10-28 21:32:38
检查Zn是不是只指定了赝势基组没指定赝势。

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