avgRDG分子动力学弱相互作用分析问题

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发布时间: 2024-10-29 22:54

各位老师我想问一下，我想用Multiwfn分析分子动力学弱相互作用的时候（使用Multiwfn研究分子动力学中的弱相互作用 - 思想家公社的门口：量子化学·分子模拟·二次元）我按卢老师的教程去操作的最后VMD生成的图形原子 ...

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KCM@SHU 发表于 Post on 2024-11-1 16:48:02

sobereva 发表于 2024-10-30 23:59
我从来不用OVITO，不回答相关问题

好的老师，已经解决啦，是lammps输出文件的问题，lammps和OVITO输出轨迹的xyz文件虽然和标准的格式很像，但是不知道为啥放进VMD里面就不行，我把lammps输出其他文件就可以了

sobereva 发表于 Post on 2024-10-30 23:59:34

KCM@SHU 发表于 2024-10-30 14:18
老师好像不是文件格式的问题，我是用OVITO输出的xyz文件，我发现我分析的帧数多了好像就会出现这种问题， ...

我从来不用OVITO，不回答相关问题

sobereva 发表于 Post on 2024-10-30 01:49:01

给Multiwfn用的xyz文件应当满足下文说的规范，各个原子都用的元素名，否则Multiwfn没法正确判断各个原子是什么元素
谈谈记录化学体系结构的xyz文件
http://sobereva.com/477

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