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利用dmol3计算CuCH3的Mulliken电荷疑问

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发布时间: 2017-1-17 12:03

正文摘要:

本帖最后由 tjugonghao 于 2017-1-17 15:26 编辑 各位前辈好!小弟初来乍到,最近在计算简单Cu/C/H结构的Mulliken电荷,如CuCH3,遇到一些问题: 1.赝势的选择,ECP和All Electron计算结果差异很大; 2.考不考 ...

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喵星大佬 发表于 Post on 2021-4-9 19:18:41
本帖最后由 喵星大佬 于 2021-4-9 19:20 编辑
cdcdcd 发表于 2021-4-9 10:17
请问你是怎么算Mulliken电荷的呀?我也需要计算,能看看你的input文件吗?

在选项Properties里面,Population analysis选项Mulliken分析子选项里面可以选到Mulliken原子电荷,Hirshfeld电荷和ESP电荷也在这个里面选。

charge.png (16.62 KB, 下载次数 Times of downloads: 85)

charge.png
cdcdcd 发表于 Post on 2021-4-9 10:17:04
tjugonghao 发表于 2017-1-18 09:45
嗯,谢谢建议!课题里面用到是Mulliken电荷,其实我就是想计算Mulliken电荷,至于用dmol3还是Gaussian都 ...

请问你是怎么算Mulliken电荷的呀?我也需要计算,能看看你的input文件吗?
tjugonghao 发表于 Post on 2017-1-18 09:45:40
卡开发发 发表于 2017-1-17 20:01
多谢前辈指点,Hrishfeld的那个我只是就基组依赖性的问题那么一说。如此说来DMol3没有合适的原子电荷用于 ...

嗯,谢谢建议!课题里面用到是Mulliken电荷,其实我就是想计算Mulliken电荷,至于用dmol3还是Gaussian都无所谓。先用dmol3算了下,如果也可以有可靠的结果那就好了。
卡开发发 发表于 Post on 2017-1-17 20:01:37
sobereva 发表于 2017-1-17 16:24
从文档中的理论介绍看,不是那篇。那篇是RESP电荷,RESP电荷比普通拟合静电势电荷复杂得多。
dmol3里 ...

多谢前辈指点,Hrishfeld的那个我只是就基组依赖性的问题那么一说。如此说来DMol3没有合适的原子电荷用于力场,我觉得楼上完全可以换Gaussian或者ORCA来做。
sobereva 发表于 Post on 2017-1-17 16:24:54
卡开发发 发表于 2017-1-17 15:59
@sobereva DMol3除了Mulliken还有Hirshfeld,非周期能计算ESP电荷(看help文档应该是 J. Phys. Chem., 97 ...

从文档中的理论介绍看,不是那篇。那篇是RESP电荷,RESP电荷比普通拟合静电势电荷复杂得多。(不过如果用Multiwfn计算,非常简单,见《RESP拟合静电势电荷的原理以及在Multiwfn中的计算》 http://sobereva.com/441
dmol3里的拟合静电势公式不严格属于任何一种标准方法,不像常用的MK、CHELP、CHELPG电荷那样把那些拟合点考虑的空间范围明确考虑划分清楚,而是引入了平滑变化的权重函数,这种做法有其合理性,不过貌似没发表。拟合静电势电荷还一个大问题是内部原子拟合质量差,像当前体系里甲基碳的合理性就会略低于氢。另外就是原子半径的选择有任意性。
Hirshfeld电荷严重问题是数值偏小,因此对静电势重现性极差,比Mulliken电荷还差,所以如果用于力场,如果不做额外的校正(诸如ADCH的那种原子偶极校正),结果会相当糟糕。
卡开发发 发表于 Post on 2017-1-17 15:59:21
tjugonghao 发表于 2017-1-17 15:14
嗯,非常感谢!其实我也不想计算Mulliken,奈何反应力场里面电荷用的是Mulliken电荷...

@sobereva DMol3除了Mulliken还有Hirshfeld,非周期能计算ESP电荷(看help文档应该是 J. Phys. Chem., 97, 10269-10280 (1993)的方法,不知道性能如何)。就基组依赖性这个问题而言同样输出的Hirshfeld要比Mulliken靠谱多了。
tjugonghao 发表于 Post on 2017-1-17 15:14:31
sobereva 发表于 2017-1-17 15:01
Mullike不推荐用,但鉴于Dmol3后处理极弱,也只能如此了

嗯,非常感谢!其实我也不想计算Mulliken,奈何反应力场里面电荷用的是Mulliken电荷...
sobereva 发表于 Post on 2017-1-17 15:01:47
tjugonghao 发表于 2017-1-17 14:59
谢谢卢天老师!刚刚看了那篇文献,那是不是说对于我体系的Mulliken电荷计算,b3lyp+all electron (其他 ...

Mullike不推荐用,但鉴于Dmol3后处理极弱,也只能如此了
tjugonghao 发表于 Post on 2017-1-17 14:59:39
sobereva 发表于 2017-1-17 12:16
1 Mulliken点和对基组很敏感,不同基组结果差异大很正常。参看此文的讨论《原子电荷计算方法的对比》(http ...

谢谢卢天老师!刚刚看了那篇文献,那是不是说对于我体系的Mulliken电荷计算,b3lyp+all electron (其他设置不变)的可信度最高呢?
sobereva 发表于 Post on 2017-1-17 12:16:31
1 Mulliken电荷对基组很敏感,不同基组结果差异大很正常。参看此文的讨论《原子电荷计算方法的对比》(http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract27818.shtml

2 前四周期都不用考虑

3 色散校正不影响波函数,所以加不加都一样。除非你单独做了优化,此时才会影响

4 一般就用B3LYP就完了。PBE也可以。M11L的结果看起来有点离谱。

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