计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

vmd能不能把1250帧全部扫描保存成一个pdb?

查看数: 504 | 评论数: 2 | 收藏 Add to favorites 0
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2024-10-30 19:19

正文摘要:

我在amber里边跑了1250帧,然后在vmd中用拓扑配上轨迹文档,我想截取一下离肽链3埃米以内的所有的蛋白质残基,因为每一帧都不一样的构象,我想把1250帧只要距离蛋白3埃都截下来保存成一个pdb文档,这样能做到吗?肽 ...

回复 Reply

Ruzhuang 发表于 Post on 2024-10-31 19:37:33
sobereva 发表于 2024-10-31 16:06
用动态选区时,VMD保存时只对其中第一帧的结构判断哪些原子被写入轨迹文件

只有埃,没有埃米[/backcolor ...

谢谢sob老师
sobereva 发表于 Post on 2024-10-31 16:06:48
用动态选区时,VMD保存时只对其中第一帧的结构判断哪些原子被写入轨迹文件

只有埃,没有埃米

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-1-25 05:33 , Processed in 0.168100 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list