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amber生成拓扑出现错误求助

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teacher7

发布时间: 2024-10-31 20:06

正文摘要:

各位专家，我在amber中生成拓扑，输入了以下命令，出现这个错误，应该怎么解决？ source leaprc.protein.ff14SBsource leaprc.water.spcefree = loadpdb1aki.amber.pdbsolvateBox free TIP3PBOX 14.0addIons free C ...

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Huschein 发表于 Post on 2024-11-5 23:44:36

蛋白先用pdbfixer或者pdb4amber修完再说，你这一看就是没修过的

student0618 发表于 Post on 2024-11-1 10:41:43

teacher7 发表于 2024-10-31 20:36
source leaprc.protein.ff14SB
老师你好，我把命令改成了这个，结果出现了更多的错误
source leaprc.wa ...

loadpdb 时有其他信息的，看看是哪残基出问题缺参数。

student0618 发表于 Post on 2024-10-31 20:12:17

loadpdb 是否少了个空格？

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