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计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 分子模拟 (Molecular Modeling) › 求助残基在残基拓扑库中找不到的问题

求助残基在残基拓扑库中找不到的问题

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发布时间: 2024-11-6 17:12

正文摘要:

本帖最后由 wangtao23 于 2024-11-6 18:04 编辑分子是吡啶盐结合氨基酸的头基加上两条疏水尾链，使用Gaussian，hatree-fork优化结构后，保存了mol2文件，进入avogadro和multiwfn转成pdb文件都试过了，转化的pdb ...

回复 Reply

sobereva 发表于 Post on 2024-11-9 08:50:32

默写10遍Hartree-Fock

先搞清楚力场目录下的rtp文件是干嘛的，pdb2gmx的运作机制是什么。用pdb2gmx处理的结构文件里的所有残基名在rtp里必须都先定义

wangtao23 发表于 Post on 2024-11-8 19:44:03

Loading0760 发表于 Post on 2024-11-7 10:03:11

学习非标准残基的力场构建
http://bbs.keinsci.com/thread-26023-1-1.html
http://bbs.keinsci.com/thread-36353-1-1.html
http://bbs.keinsci.com/thread-47584-1-1.html

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