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求助残基在残基拓扑库中找不到的问题

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发布时间: 2024-11-6 17:12

正文摘要:

本帖最后由 wangtao23 于 2024-11-6 18:04 编辑 分子是吡啶盐结合氨基酸的头基加上两条疏水尾链,使用Gaussian,hatree-fork优化结构后,保存了mol2文件,进入avogadro和multiwfn转成pdb文件都试过了,转化的pdb ...

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sobereva 发表于 Post on 2024-11-9 08:50:32
默写10遍Hartree-Fock

先搞清楚力场目录下的rtp文件是干嘛的,pdb2gmx的运作机制是什么。用pdb2gmx处理的结构文件里的所有残基名在rtp里必须都先定义
wangtao23 发表于 Post on 2024-11-8 19:44:03
Loading0760 发表于 Post on 2024-11-7 10:03:11

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