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求助:模拟多肽和二价锰离子的自组装,对多肽进行乙酰化和酰胺化修饰后,跑MD无法稳定

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发布时间: 2024-11-7 16:19

正文摘要:

各位大佬好,我目前在水溶液中进行多肽和锰离子的自组装模拟,之前对多肽和锰离子做动力学模拟时,对多肽制作拓扑时 -ter 选择的是TIP3P水,然后选择“NH3+”和“COO-”作为终点,使用的CHARMM36力场,之后进行在10 ...

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student0618 发表于 Post on 2026-1-30 12:12:36
sunhongxun 发表于 2026-1-29 15:19
大佬 如何使用pymol对N端乙酰化修饰?感谢解答

PyMOL的builder 封端可以用NME/ACE
sunhongxun 发表于 Post on 2026-1-29 15:19:43
大佬 如何使用pymol对N端乙酰化修饰?感谢解答

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