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计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 分子模拟 (Molecular Modeling) › 求助:模拟多肽和二价锰离子的自组装，对多肽进行乙酰化 ...

求助:模拟多肽和二价锰离子的自组装，对多肽进行乙酰化和酰胺化修饰后，跑MD无法稳定

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发布时间: 2024-11-7 16:19

正文摘要:

各位大佬好，我目前在水溶液中进行多肽和锰离子的自组装模拟，之前对多肽和锰离子做动力学模拟时，对多肽制作拓扑时 -ter 选择的是TIP3P水，然后选择“NH3+”和“COO-”作为终点，使用的CHARMM36力场，之后进行在10 ...

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student0618 发表于 Post on 2026-1-30 12:12:36

sunhongxun 发表于 2026-1-29 15:19
大佬如何使用pymol对N端乙酰化修饰？感谢解答

PyMOL的builder 封端可以用NME/ACE

sunhongxun 发表于 Post on 2026-1-29 15:19:43

大佬如何使用pymol对N端乙酰化修饰？感谢解答

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