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求助:使用Multiwfn通过单位球面表示法图形化超极化率张量的显示问题

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发布时间: 2024-11-13 17:39

正文摘要:

本帖最后由 lanyangyang 于 2024-11-14 09:38 编辑 各位老师好,我在用使用Multiwfn通过单位球面表示法图形化超极化率张量时,我画出来的图为什么结构不在单位球面的中心,结构并没有由超极化率张量的箭头环绕着 ...

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sobereva 发表于 Post on 2025-6-10 22:03:16
lanyangyang 发表于 2025-6-10 17:51
sob老师,我把polar任务的gjf文件中的坐标取自几何优化任务输出文件中的标准朝向下解决了这个问题,我还 ...

使用Multiwfn通过单位球面表示法图形化考察(超)极化率张量
http://sobereva.com/547http://bbs.keinsci.com/thread-16960-1-1.html
上文明确说了
上图中的绿色箭头体现了(beta_X,beta_Y,beta_Z)矢量方向,亦即体现出了分子beta的整体取向。可见绿色箭头的方向和球面上所有箭头的总趋势(矢量和)相同,都是朝右。显然,这种矢量表示法所展现的信息远没有球面表示法那么丰富,细节无法体现。
体系明显不同,元素根本不一样
sobereva 发表于 Post on 2024-11-15 11:42:16
lanyangyang 发表于 2024-11-14 16:12
1.  先在Multiwfn里导入polar.out文件,输入24  //(超)极化率分析
2.  输入1  //解析Gaus ...

通过界面里的-1 Set sphere radius选项,可以把球型尺寸改大

你用了nosymm,而且gjf里体系中心又不在原点,所以才会偏离。gview里显示笛卡尔坐标轴便知
可以用下文的功能让pdb里的体系居中,导出新的pdb,然后再放到VMD里显示
Multiwfn中非常实用的几何操作和坐标变换功能介绍
http://sobereva.com/610http://bbs.keinsci.com/thread-24674-1-1.html
sobereva 发表于 Post on 2024-11-14 11:20:24
lanyangyang 发表于 2024-11-14 09:36
sob老师,具体操作完全按照你的博文来操作的,所需要的输入文件已附上,您看看这是什么原因导致的

把输入的每一条命令完整贴出来
lanyangyang 发表于 Post on 2024-11-14 09:36:09
sobereva 发表于 2024-11-14 05:34
没有操作细节、具体输入文件没法说

当前只能告诉你,认真看清楚下文每一步操作,以及用的都是什么文件

sob老师,具体操作完全按照你的博文来操作的,所需要的输入文件已附上,您看看这是什么原因导致的
sobereva 发表于 Post on 2024-11-14 05:34:52
没有操作细节、具体输入文件没法说

当前只能告诉你,认真看清楚下文每一步操作,以及用的都是什么文件
使用Multiwfn通过单位球面表示法图形化考察(超)极化率张量
http://sobereva.com/547http://bbs.keinsci.com/thread-16960-1-1.html

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