分子动力学模拟配体准备，resp电荷文件准备过程报错

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发布时间: 2024-11-14 22:46

各位老师好，我想用蛋白质和环糊精进行分子动力学模拟分析其相互作用。我使用了分子对接后的配体环糊精构象进行配体准备。在Gaussian中进行配体准备，在查阅了公社的相关资料后我决定使用 %nprocshared=32 %mem= ...

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听风饮雪 发表于 Post on 2024-11-16 09:10:53

sobereva 发表于 2024-11-15 12:50
多给点内存再试。如果死活解决不了就甭做振动分析。本来下文的脚本就都没有做振动分析这一步
计算RESP原子 ...

谢谢sob老师的指点！！

sobereva 发表于 Post on 2024-11-15 12:50:19

多给点内存再试。如果死活解决不了就甭做振动分析。本来下文的脚本就都没有做振动分析这一步
计算RESP原子电荷的超级懒人脚本（一行命令就算出结果）
http://sobereva.com/476（http://bbs.keinsci.com/thread-12858-1-1.html）

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