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请教CP2K计算Pd(111)表面吸附有机分子的两个问题

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胡说

发布时间: 2024-11-15 11:14

正文摘要:

各位老师好，请教个关于CP2K计算Pd(111)表面吸附有机分子结构优化和能量计算的问题。我想用CP2K重复文献中Pd(111)表面吸附有机分子的能量变化计算（文献用的VASP），如下图所示：问题2：那么计算反应前后能 ...

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胡说 发表于 Post on 2024-11-16 14:00:08

ChemG 发表于 2024-11-15 13:36
至少应该把输入文件和结构文件放上来才能看出来是哪里的问题。

谢谢，可能是我的输入文件不合适，我先自己检查下

胡说 发表于 Post on 2024-11-16 13:59:08

sobereva 发表于 2024-11-15 12:16
没具体输入文件没法说，应当是输入文件有硬伤（诸如用PSOLVER MT结合二维周期性时，分子竖着的时候盒子Z方 ...

好的，谢谢老师，我先按照您说的检查下输入/输出文件。

ChemG 发表于 Post on 2024-11-15 13:36:50

至少应该把输入文件和结构文件放上来才能看出来是哪里的问题。

sobereva 发表于 Post on 2024-11-15 12:16:16

没具体输入文件没法说，应当是输入文件有硬伤（诸如用PSOLVER MT结合二维周期性时，分子竖着的时候盒子Z方向尺寸不够），否则不可能跑飞。并且注意检查SCF是否充分收敛了

求差的时候两个结构的化学组成必须精确相同。诸如掉下来的片段必须也带着一起算（或者两个片段单独算的能量加和作为产物能量），才能和反应物能量求差

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