Sunca 发表于 2024-11-20 19:29 减小统计间隔，图像自然就细腻了 可以结合sigamplot绘制，如下文一样 浅谈PCA与g_covar+g_anaeig+ddtdp+sigmaplot做自由能面图的方法 http://sobereva.com/73 |
参考北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/KGMX）的ppt：
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本帖最后由 student0618 于 2024-11-19 20:30 编辑 个人比较喜欢用VMD算这个。VMD load好轨迹后快捷键4点四个原子，graphics-labels的视窗选dihedral，graph栏按graph。还可以很方便地作个二面角变化的动画。 GMX 可看看 https://manual.gromacs.org/current/onlinehelp/gmx-angle.html |
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