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Gaussian16做含锰原子结构优化,分子构象成键变化太大

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发布时间: 2024-11-19 19:17

正文摘要:

各位大佬好,最近在做含锰原子结构优化,对C、N、H用pbe1pbe/6-31G,Mn用LanL2DZ分析计算,发现分子成键形式改变巨大,最后计算报错,请问怎么解决? 输入文件118.gif 输出.out文件上传不了,放个原子构象截 ...

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pcw94121 发表于 Post on 6 day ago
zjxitcc 发表于 2024-11-20 12:29
我求求你不要再自己创造基组了。再次强调,先仔细阅读3L和4L推荐的博文。

好的,我确实不会,下次有机会去参加基础培训。感谢指导!!!
pcw94121 发表于 Post on 6 day ago
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2024-11-20 12:18
6-31+G那个+是弥散函数,6-31G*的*是极化函数,不是一个概念也不能混淆、写错。推荐读一读
基组入门资料 ...

感谢科普!!!
zjxitcc 发表于 Post on 6 day ago
pcw94121 发表于 2024-11-20 12:12
好的感谢感谢,是因为在gaussian16里面的是6-31G+吗?我看很多地方都是6-31G*

我求求你不要再自己创造基组了。再次强调,先仔细阅读3L和4L推荐的博文。
pcw94121 发表于 Post on 6 day ago
kimariyb 发表于 2024-11-20 12:18
你结构优化成这样的原因是你没有定义赝势,用了赝势基组不定义赝势当然不对。你实在不知道就写 def2SVP,省 ...

好的感谢感谢
kimariyb 发表于 Post on 6 day ago
你结构优化成这样的原因是你没有定义赝势,用了赝势基组不定义赝势当然不对。你实在不知道就写 def2SVP,省这么多麻烦事
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 Post on 6 day ago
pcw94121 发表于 2024-11-20 12:12
好的感谢感谢,是因为在gaussian16里面的是6-31G+吗?我看很多地方都是6-31G*

6-31+G那个+是弥散函数,6-31G*的*是极化函数,不是一个概念也不能混淆、写错。推荐读一读
基组入门资料小合集,另外也参加一个科音的初级量子化学培训班

还是挺好奇你输入文件里的初始结构是怎么构建/获取的,实在不符合化学直觉……
pcw94121 发表于 Post on 6 day ago
zjxitcc 发表于 2024-11-20 11:36
可以。不过不要再写一些6-31*G之类不存在的东西了(就在你上传的附件里1188.gjf有),提交计算前先仔细阅 ...

好的感谢感谢,是因为在gaussian16里面的是6-31G+吗?我看很多地方都是6-31G*
zjxitcc 发表于 Post on 6 day ago
pcw94121 发表于 2024-11-20 09:32
好的,我没有太懂混合基组就把sob老师的案例抄了下来。请问我用6-311G*定义CHNO,用SDD定义Mn可以吗?

可以。不过不要再写一些6-31*G之类不存在的东西了(就在你上传的附件里1188.gjf有),提交计算前先仔细阅读3L和4L推荐的博文,抄也要理解了再抄。
fatpig 发表于 Post on 6 day ago
不想用混合基组,就直接 def2svp 搞定...
pcw94121 发表于 Post on 6 day ago
sobereva 发表于 2024-11-20 05:28
另外,没事甭用过时的Lanl2DZ,仔细看
谈谈赝势基组的选用
http://sobereva.com/373(http://bbs.keinsci ...

好的,谢谢sob老师
pcw94121 发表于 Post on 6 day ago
zjxitcc 发表于 2024-11-19 20:05
是gjf,不是gif;基组写错了;没给Mn定义赝势。急需仔细阅读Sob老师这篇博文
详解Gaussian中混合基组、自 ...

好的,我没有太懂混合基组就把sob老师的案例抄了下来。请问我用6-311G*定义CHNO,用SDD定义Mn可以吗?
sobereva 发表于 Post on 6 day ago
另外,没事甭用过时的Lanl2DZ,仔细看
谈谈赝势基组的选用
http://sobereva.com/373http://bbs.keinsci.com/thread-5625-1-1.html

用6-31G完全是开玩笑。好好看下文了解常识
谈谈量子化学中基组的选择
http://sobereva.com/336http://bbs.keinsci.com/thread-3545-1-1.html

zjxitcc 发表于 Post on 7 day ago
是gjf,不是gif;基组写错了;没给Mn定义赝势。急需仔细阅读Sob老师这篇博文
详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝势基组的输入
http://sobereva.com/60
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 Post on 7 day ago
先不说侧链有没有考虑过构象搜索,中间这扭曲如藤蔓般的结构究竟是哪来的,看了半天愣是没认出来卟啉环配体……

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