计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

求助:请问一下IRC曲线出现多个弯,正常吗?

查看数: 85 | 评论数: 6 | 收藏 Add to favorites 0
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2024-11-19 20:49

正文摘要:

在过渡态搜索时,找到了过渡态,但是跑IRC时发现有多个弧度,请问一下这样的过渡态是否正确?或者是IRC搜索出现了什么问题?为了查看过渡态的趋势,先用半经验方法PM6试出来的过渡态,IRC也是半经验跑出来的。是否与 ...

回复 Reply

fuhua 发表于 Post on 7 day ago
sobereva 发表于 2024-11-20 05:38
中途拐弯并没有什么必然问题,通常暗示反应过程有多个stage,可以从电子结构重排/成键方式改变的角度讨论原 ...

十分感谢sob老师,我多尝试一下~
fuhua 发表于 Post on 7 day ago
sai77 发表于 2024-11-19 21:43
《在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题》
http://sobereva.com/400
里面有类似的例子

好嘞 十分感谢老师
sobereva 发表于 Post on 7 day ago
中途拐弯并没有什么必然问题,通常暗示反应过程有多个stage,可以从电子结构重排/成键方式改变的角度讨论原因。但图中央过渡态位置的曲线显得很尖,如果放大了看就是个尖峰,那倒是有问题。

PM6的精度有限,不代表DFT得到的IRC曲线也能类似。如果怀疑结果,应当用DFT跑
Huschein 发表于 Post on 7 day ago
你只是作为学习的话 半经验没关系,整体趋势是对的,但是可能方法精度不高吧
sai77 发表于 Post on 2024-11-19 21:43:09
《在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题》
http://sobereva.com/400
里面有类似的例子
fuhua 发表于 Post on 2024-11-19 20:51:35
%nprocshared=32
%mem=20GB
%chk=D:\G16W\Scratch\gv11_19_2024_20_50_53\Preview_ml5ej.chk
# irc=(calcfc,maxpoints=400,lqa) upm6 nosymm

Title Card Required

1 1
Ti              -1   -4.68100500   -2.78520800   -1.38874500
O               -1   -6.62179200   -2.78059500   -1.38872300
Ti              -1   -1.82516700   -4.88217000   -1.38874500
O               -1   -1.23966700   -6.73253900   -1.38872400
O               -1   -4.80718800   -4.12944400   -2.71692300
O               -1   -3.06992300   -5.40500700   -0.06052300
O               -1   -4.80715800   -4.12940400   -0.06052300
O               -1   -3.06995200   -5.40504700   -2.71692300
O               -1   -2.72614600   -3.11605400   -1.38876200
C               -1   -4.07827200   -4.95750500   -3.16141900
H               -1   -4.31411800   -5.44536600   -4.16440900
C               -1   -4.07823200   -4.95745100    0.38398100
H               -1   -4.47307400   -5.32851900    1.38699100
Ti              -1    0.90367300   -4.46427200   -1.38874500
O               -1    0.89906000   -6.40505900   -1.38872300
Ti              -1    3.00103400   -1.60834500   -1.38892600
O               -1    4.85101000   -1.02294700   -1.38891100
O               -1   -0.53529700   -4.18630400   -2.72237000
O               -1   -0.53526700   -4.18626400   -0.05517000
O               -1    2.24790900   -4.59045500   -2.71692300
O               -1    3.52335500   -2.85321900   -0.06050300
O               -1    2.24786900   -4.59042500   -0.06052300
O               -1    3.52349900   -2.85325700   -2.71689000
O               -1    1.23451400   -2.50940300   -1.38874500
C               -1   -0.05836800   -7.29885900   -1.38872900
H               -1    0.19869900   -8.40943700   -1.38871500
C               -1    3.07594700   -3.86151000   -3.16145700
H               -1    3.56383100   -4.09738500   -4.16440900
C               -1    3.07591600   -3.86149900    0.38398100
H               -1    3.44699000   -4.25634100    1.38698900
Ti              -1   -3.00184300    2.79981700   -1.38877400
O               -1   -2.99739300    4.74025800   -1.38862300
Ti              -1   -5.09890300   -0.05636800   -1.38874500
O               -1   -6.94927200   -0.64186800   -1.38872400
O               -1   -4.40303700   -1.34623800   -2.72237000
O               -1   -4.40299700   -1.34626800   -0.05517000
O               -1   -4.34628100    2.92574600   -2.71680300
O               -1   -5.62174000    1.18838800   -0.06052300
O               -1   -4.34615400    2.92551800   -0.06053000
O               -1   -5.62178000    1.18841700   -2.71692300
O               -1   -3.33276300    0.84460700   -1.38879100
C               -1   -7.51559200   -1.82316700   -1.38872900
H               -1   -8.62617000   -2.08023400   -1.38871500
C               -1   -5.17415700    2.19670000   -3.16150900
H               -1   -5.66209900    2.43258300   -4.16440900
C               -1   -5.17418400    2.19669700    0.38398100
H               -1   -5.54525200    2.59153900    1.38699100
Ti              -1    2.58153700    1.12142400   -1.38885500
O               -1    4.52352300    1.11557000   -1.38864100
Ti              -1   -0.27326600    3.21708500   -1.38884600
O               -1   -0.85841400    5.06790200   -1.38877500
O               -1    2.30526900   -0.31904700   -2.72193700
O               -1   -1.56293500    2.52147000   -2.72238400
O               -1    2.30483300   -0.31867500   -0.05526800
O               -1   -1.56293600    2.52142000   -0.05499500
O               -1    2.70891600    2.46398100   -2.71759700
O               -1    0.97157300    3.74005700   -2.71711900
O               -1    0.62796200    1.45134500   -1.38845100
C               -1    5.41734500    0.15829700   -1.38825200
H               -1    6.52789500    0.41550500   -1.38903600
C               -1   -2.03996400    5.63392100   -1.38866000
H               -1   -2.29696700    6.74463500   -1.38876200
C               -1    1.98031700    3.29321300   -3.16082200
H               -1    2.21585000    3.78056400   -4.16440900
H               -1    0.04026600    0.65097800   -1.38936200
H               -1   -2.53251300    0.25699900   -1.38910000
H               -1    0.43424500   -1.92180100   -1.38910000
H               -1   -2.13853400   -2.31578000   -1.38910000
C                0    4.76398400    7.26682100    0.63389000
C                0    5.32865300    5.95117600    0.09040800
C                0    4.20557900    4.94267700   -0.17250400
C                0    3.35762300    4.67336500    1.08531600
C                0    2.82836300    5.99741700    1.69158000
C                0    3.96836800    7.01624800    1.91570400
C                0    2.18262800    5.76100800    3.05030600
O                0    1.57705200    6.88695900    3.48779800
O                0    1.39018400    3.26055100    1.73304100
C                0    2.18885100    3.73735600    0.74207800
O                0    2.19457600    4.72238000    3.69444400
O                0    1.63080100    3.75633200   -0.38873100
C                0    0.94103400    6.88661800    4.81868500
C                0    1.11160200    8.26580300    6.90216800
C                0    1.92042700    7.54328700    5.80418100
C                0    1.92330300    9.36801800    7.59454300
C                0    1.13019700   10.01865400    8.73593000
C                0    2.88875600    6.49119000    6.38420200
C                0    4.21530500    7.09535100    6.83308800
C                0    1.93336100   11.12106900    9.42137600
H                0    4.12373800    7.75297800   -0.12842500
H                0    5.58534500    7.98268200    0.83573100
H                0    5.88844300    6.13751500   -0.84714300
H                0    6.06570200    5.53104300    0.80236400
H                0    4.65104300    3.98257300   -0.52013200
H                0    3.55785100    5.31568700   -0.99140600
H                0    4.00602300    4.16869600    1.85344300
H                0    2.07284400    6.45116200    0.99793500
H                0    4.64870600    6.65689000    2.71425000
H                0    3.53412600    7.96789200    2.28962300
H                0    1.76742100    3.31844200    2.68005000
H                0    0.65185200    5.85801300    5.09268600
H                0    0.04364400    7.49963900    4.61651400
H                0    0.75766200    7.53260000    7.65330600
H                0    0.19569500    8.71539700    6.46933300
H                0    2.51198900    8.30339500    5.23198700
H                0    2.87384800    8.94393000    7.99028600
H                0    2.22313700   10.13864200    6.85890800
H                0    0.84023800    9.25134800    9.48075500
H                0    0.18048200   10.43642100    8.34766500
H                0    2.41047900    5.96893900    7.23690100
H                0    3.08273000    5.69938800    5.63073900
H                0    4.76746600    7.54246600    6.00040600
H                0    4.86134000    6.33771300    7.29104100
H                0    4.05669200    7.88728300    7.58559100
H                0    1.35920800   11.58103400   10.23467200
H                0    2.20497100   11.92092100    8.72304800
H                0    2.86236100   10.73642500    9.85745300
H                0    2.09750300   -0.20194900    0.90074200
C                0    8.69701000    1.43972400   -1.22407700
H                0    7.97653100    0.70326400   -1.61803400
H                0    9.15658800    1.94032100   -2.08699800
H                0    9.49685000    0.88146000   -0.71930000
C                0    8.03268700    2.44596000   -0.28821600
H                0    7.27826500    3.03374800   -0.84879500
H                0    8.78328100    3.19187700    0.04433100
C                0    7.39783200    1.77245600    0.94011400
H                0    8.04205100    1.94299900    1.82620500
H                0    7.39297500    0.67235200    0.82109500
C                0    5.97939900    2.28689300    1.22784700
H                0    6.03236800    3.16304900    1.90255900
H                0    5.51193600    2.67759000    0.29422200
C                0    5.07224600    1.20187600    1.83530300
H                0    5.23281900    0.24750000    1.28435000
C                0    5.45569200    0.94741300    3.31292000
H                0    6.55793900    0.84635700    3.38799400
H                0    5.20473500    1.83053800    3.93321900
C                0    4.80060500   -0.29962600    3.89837400
H                0    5.17116900   -0.49232200    4.91484400
H                0    3.71233400   -0.20114200    3.97529700
H                0    5.01759700   -1.19402700    3.30463100
C                0    3.57747300    1.59863200    1.78157000
H                0    3.40019400    2.43064800    2.50503300
H                0    2.93974400    0.74912300    2.11797100
O                0    3.10406400    2.03378700    0.51648400

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 08:31 , Processed in 0.335000 second(s), 27 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list