【已解决】分子进行位置限制后，同一个top文件，em正常，nvt报错

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sdf

发布时间: 2024-11-19 21:00

本帖最后由 sdf 于 2024-11-20 09:53 编辑请问各位大神，我在模拟气体团簇吸附，原本想着对2000个同样的氮气分子组成的团簇进行位置限制，因此我对模型结构文件water.gro通过以下命令进行处理：对2000个氮气分子 ...

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sdf 发表于 Post on 3 day ago

谢谢大神提醒，是我想错陷入死循环啦

Seyilaxa 发表于 Post on 3 day ago

对氮气分子的两个原子建立限制就行了，[ position_restraints ] 针对的是[moleculetype]写的

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