现在有了一个md平衡态的结构如下: 第二步使用上述生成的ndx文件,生成PDB文件。 第二个问题就是: 我想使用gmx trjconv -f prd-mol.xtc -s prd.tpr -o prd.pdb -n test.ndx 导出pdb时,怎样能使得这个溶剂化 ...
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