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gaussview添加乙酰基团如何完成

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哼哼2001

发布时间: 2024-11-26 00:27

正文摘要:

在Gview中添加乙酰基团应该如何正确完成？各位老师们，想请教一下gaussview画图的相关问题。我使用的是pdb格式的蛋白质结构，我把两个氢原子删除然后在氮原子上连接了一个乙酰基团，用clean进行了简单的优化，标注 ...

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哼哼2001 发表于 Post on 2024-11-26 11:46:27

sobereva 发表于 2024-11-26 08:48
直接画上去就完了，甭点clean，否则可能结构变得明显更烂
你只需要关注坐标，别管可视化程序怎么显示的。 ...

谢谢老师，我试着用修改后的蛋白想用HADDOCK做蛋白质对接，但是显示“Error in PDB file.Issue when parsing the PDB file at line 2.X,Y,Z coordinates, occupancy, and temperature (b) factors must be decimal numbers.”，这个怎么能处理好呢老师

sobereva 发表于 Post on 2024-11-26 08:48:15

直接画上去就完了，甭点clean，否则可能结构变得明显更烂
你只需要关注坐标，别管可视化程序怎么显示的。而且要看也是用CPK或licorice等方式看，搞清楚new cartoon风格适合什么情况

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