原来是NN之间有虚线就是了...我还在那里看形状，好多没接触过的东西真是不知道怎么看呀，哈哈

对

你就无视红绿就行了。或者gview里把正/负部分等值面颜色正好改成反的。或者用Multiwfn生成分子轨道格点数据，在后处理界面选择令格点数据数值乘以-1然后再观看（或者再导出成cube文件后用gview、VMD等观看）。

对

不用考察得那么细致、有几条线等等。只要原子之间是虚线区域，就代表密度下降了。

sobereva 发表于 2014-11-3 00:06
这是整个体系的轨道，已经组合到了一起了，虽然也能看得出因为相位匹配而组成了复合物轨道，但没法最透彻地 ...

--这是整个体系的轨道，已经组合到了一起了，虽然也能看得出因为相位匹配而组成了复合物轨道，但没法最透彻地看到片段轨道间的匹配。如果把两个片段的相应片段轨道同时显示出来，看看交叠程度和相位匹配程度，那样更明确。
您的意思是我应该像cda教程那样分别把99轨道的frag1 frag2贡献最大的occ0和occ2的部分按照坐标方向摆在一起么，就像我第二幅那个问N3成分的图那样？

--红绿相反无所谓，可以把一个体系所有轨道相位同时反转，这不影响体系任何性质。
似乎没找到gv有这个功能..我用multiwfn试试吧

--那个N3的轨道，可以用NAO方法分析一下轨道成份。这三个N应该都用了s和p轨道，
您指的是说明书的4.8.2 Analysis on water by natural atomic orbital method吧

--N-N键中间的密度降低了，反映出N-N键强度有削弱的迹象。
只看出第一张N旁边的密度梯度都扭转了，中间那个N横向虚线数目一样，纵向实线第一张发散了并且虚线数目不一样，怎么判断的呢

这是整个体系的轨道，已经组合到了一起了，虽然也能看得出因为相位匹配而组成了复合物轨道，但没法最透彻地看到片段轨道间的匹配。如果把两个片段的相应片段轨道同时显示出来，看看交叠程度和相位匹配程度，那样更明确。

红绿相反无所谓，可以把一个体系所有轨道相位同时反转，这不影响体系任何性质。

那个N3的轨道，可以用NAO方法分析一下轨道成份。这三个N应该都用了s和p轨道，

N-N键中间的密度降低了，反映出N-N键强度有削弱的迹象。

N3两边那块，和ELF没有直接关联，虽然都反映的是孤对电子区域。ELF衡量的是当前的情况，而密度差衡量的是变化情况。

电子密度图本身没什么用。

配位键属于极性共价键，但是其ELF图由于配位原子和金属之间的空缺总是容易被误认为是非共价相互作用，那实际上往往是过渡金属的原子壳层的间隙区域，而非非共价相互作用区域。
离子键算是极性共价键的极端，有时候非要纠结是极性共价键还是离子键没太大意思。是否属于共价键，一个判断标准是两原子之间的能量密度的符号（通常考察的是BCP处），如果是负值，说明势能占主导，被认为是共价键的一个标志，通常的配位键都是如此；如果为正值，被认为是非共价相互作用。

你的CDA图连线太多，看不清楚，应当利用Multiwfn的选项使之精简，特别是利用规则“由两个片段贡献值必须都超过xxx”，并且调节能量范围。

你的CDA解释应该是可以的，为什么转移得更多应该是轨道相位匹配的问题。

还是应该做做密度差图，即复合物密度减去金属的密度再减去叠氮的密度，看看N-N之间密度是如何变化的，这直接有助于了解键特征的变化。

定量或者定性对比分析不同结构是没问题的。

另外可以做一下NBO分析，比较一下结合金属前后，叠氮N-N的BD和BD*的占据数怎么变化，以及原子电荷、原子轨道布居数如何改变。

顶~等待大牛来解答