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求助做AIMD后用VMD计算rdf出错

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发布时间: 2024-11-26 22:58

正文摘要:

老师您好,我在做第一性原子分子动力学(AIMD)之后想用VMD进行分析径向分布函数(RDF),在使用VMD时收到了这样的错误提示,我想请问您这是什么原因,该如何解决呢,谢谢老师!我这个体系存在三种原子Ti、H的同位素 ...

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泡泡鱼1218 发表于 Post on 2024-11-28 12:05:12
sobereva 发表于 2024-11-27 14:50
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此 ...

好的好的谢谢老师
sobereva 发表于 Post on 2024-11-27 14:50:02
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义和含糊性,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “第一性原理AIMD后处理软件VMD” 改了,以后务必注意!下次将删帖+扣分处理。
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 Post on 2024-11-26 23:12:55
标题应该具体到提问内容哦

只写个Ti不够,请看社长博文《VMD里原子选择语句的语法和例子》
http://sobereva.com/504http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html

另外注意VMD里这个RDF计算插件还是有点局限性的,若是要用于非正交盒子或者需要更好的结果可以考虑下GROMACS的gmx rdf功能。

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