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gmx服务器配置求助

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发布时间: 2024-12-2 15:36

正文摘要:

各位老师好,想购置一台服务器,主要用于gromacs跑蛋白模拟,有时候会用比较大的蛋白,盒子尺寸能达到16nm,一般跑100ns以上,看了sob老师置顶的计算机配置帖子,想请问一下在显卡的选择上面,对我我的情况,4090和4 ...

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Dempey 发表于 Post on 2024-12-3 22:19:48
961106 发表于 2024-12-3 09:13
谢谢老师解答,我现在最大的体系有180000个原子,跑100ns左右,请问这个体系这两种GPU可以带得动吗

如果是18万原子体系不算大,应该蛮轻松的。我没体验过4080S,但是我算过180万个原子的体系,跑100 ns,步长2 fs,Xeon 6430 16核+4090大约5-6天。
961106 发表于 Post on 2024-12-3 09:13:01
sobereva 发表于 2024-12-2 17:39
严重误解
4090D完全跑不动的情况,性能是其2/3左右的4080 SUPER也跑不动。没说这俩算你当前体系都跑不动 ...

谢谢老师解答,我现在最大的体系有180000个原子,跑100ns左右,请问这个体系这两种GPU可以带得动吗
sobereva 发表于 Post on 2024-12-2 17:39:21
961106 发表于 2024-12-2 17:07
老师您好,谢谢您的回复,请问您的意思是说即使用推荐的4090D,我现在这个蛋白也跑不了是吗?

严重误解
4090D完全跑不动的情况,性能是其2/3左右的4080 SUPER也跑不动。没说这俩算你当前体系都跑不动,说原子数、要跑的时间长度
961106 发表于 Post on 2024-12-2 17:07:37
sobereva 发表于 2024-12-2 15:53
一分钱一分货,花更多钱就能有更快的速度、更少的计算时间。只能说其中一个完全算不动的,另一个也算不动。

老师您好,谢谢您的回复,请问您的意思是说即使用推荐的4090D,我现在这个蛋白也跑不了是吗?
sobereva 发表于 Post on 2024-12-2 15:53:28
一分钱一分货,花更多钱就能有更快的速度、更少的计算时间。只能说其中一个完全算不动的,另一个也算不动。

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