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构建盒子后执行能量最小化失败

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发布时间: 2024-12-2 15:48

正文摘要:

本帖最后由 milk_q 于 2024-12-2 20:25 编辑 首先是chemdraw画的结构,GFN2-xTB优化后,计算RESP,参数完全基于GAFF sobtop生成拓扑参数 构建盒子后执行能量最小化提示 Polak-Ribiere Conjugate Gradients ...

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tsgyls 发表于 Post on 2024-12-2 17:41:00
可能的原因很多
比如盒子太大了,是不是先把溶剂能量最小化,再加入你的分子比较好
或者你优化结构的时候,没有仔细看结构,分子扭的厉害还直接拿来用
或者构建拓扑文件的时候,把柔性部分当做刚性结构,用hessian进行计算
sobereva 发表于 Post on 2024-12-2 15:51:24
什么细节都没有,整体结构怎么建的、拓扑文件怎么产生的,一概不提,文件也不提供,没人能回答
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html
那叫GFN2-xTB



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