关于元动力学模拟的轨迹理解问题

查看数: 649 | 评论数: 2 | 收藏 Add to favorites 0

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

发布时间: 2024-12-4 13:07

各位老师，元动力学模拟得到的轨迹是不是真实的轨迹呢？我还在学习元动力学模拟，我理解的元动力学模拟是通过偏置势使分子能够【沿着势能面】往鞍点的方向移动，最后越过鞍点到达产物态。这就引出我的一个疑问，拿该 ...

回复 Reply

SiqiLee 发表于 Post on 2024-12-12 09:52:40

应该是两个圈都能采到样，他只是降低了跨越能垒的难度，采样更广泛了。PMF是可以用这个轨迹去做的，甚至你可以用它的轨迹再去做伞形采样，可以参考南开付浩浩他们的文章，Nature protocols, 17(4), 1114–1141.

sobereva 发表于 Post on 2024-12-4 17:24:35

当前问题没体现出和CP2K的直接关系，不要选择CP2K分类。这次给你改了，以后注意

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register