计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 分子模拟 (Molecular Modeling) › 添加水分子的时候，水的位置不对怎么回事呢？

添加水分子的时候，水的位置不对怎么回事呢？

查看数: 620 | 评论数: 2 | 收藏 Add to favorites 0

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

帖子模式

pkuchemistry

发布时间: 2024-12-5 11:15

正文摘要:

定义盒子利用这个命令： gmx_mpi editconf -f 8fd9.gro -o 8fd9_box.gro -c -d 1.0 -bt cubic 得到的cell也是正常的；然后用以下命令： gmx solvate -cp 8fd9.gro -cs spc216.gro -o 8fd9_solv.gro -p topol.top ...

回复 Reply

pkuchemistry 发表于 Post on 2024-12-5 11:32:09

春天花会开发表于 2024-12-5 11:18
solvate 输入文件搞错了

谢谢，看到了。

春天花会开 发表于 Post on 2024-12-5 11:18:29

solvate 输入文件搞错了

评分 Rate

参与人数 Participants 1	eV +1	收起理由 Reason
pkuchemistry	+ 1	谢谢

查看全部评分 View all ratings

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register