求助分子构型优化过程中H原子发生移动

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发布时间: 2024-12-5 13:40

老师，请问我将通过两个物质中的质子转移反应合成了盐，形成盐的结构应该是羟基中的H原子失去变成O负离子，NH2接收H原子变成NH3阳离子，但是我通过使用g16优化红框中的H原子仍然会跑到O上。我是不是应该把H原子 ...

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lemon_electron 发表于 Post on 2024-12-5 23:34:14

做过这个原子的扫描吗（O···H or N···H键），这个未必不是优势构象

sobereva 发表于 Post on 2024-12-5 19:48:46

jiushizhege 发表于 2024-12-5 17:08
好的老师十分感谢老师带了隐式溶剂模型同时加了显示溶剂 H还是发生转移回到O负离子上，这样是不是可以将 ...

说明用的计算级别，以及用的什么溶剂

jiushizhege 发表于 Post on 2024-12-5 17:08:06

sobereva 发表于 2024-12-5 16:38
记得带隐式溶剂模型。即便对于晶体环境下模拟，这也比在真空下计算强

好的老师十分感谢老师带了隐式溶剂模型同时加了显示溶剂 H还是发生转移回到O负离子上，这样是不是可以将H固定到N上这样对计算相互作用能是否有影响呢

sobereva 发表于 Post on 2024-12-5 16:38:49

记得带隐式溶剂模型。即便对于晶体环境下模拟，这也比在真空下计算强

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