体系加入了3层MoS2纳米片跑完后散了，请教如何解决

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cgy

发布时间: 2024-12-6 19:53

各位老师好，在做单体扩散的时候加入了三层MoS2，如图1所示，但是在跑完之后三层MoS2散了，如图2所示。我又采用冻结MoS2之后发现跑完MoS2没有发生移动，如图3所示。我想请问老师有没有可以实现三层MoS ...

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Eianghuan 发表于 Post on 2025-6-18 11:53:48

cgy 发表于 2025-3-9 19:35
太客气了您，确实需要根据文献手动加电荷

请教老师，您的三层MoS2看着用的不是周期性体系，请问是做边缘饱和了吗，可以请教一下用什么方法吗

cgy 发表于 Post on 2025-3-9 19:35:39

zzvion 发表于 2025-3-7 13:40
感谢您的回答，但是UFF和CVFF是不是都没有有电荷项啊，我想做吸附，是不应该根据计算去添加呢

太客气了您，确实需要根据文献手动加电荷

zzvion 发表于 Post on 2025-3-7 13:40:36

cgy 发表于 2025-3-7 10:47
gromacs里面用的UFF力场，materials studio里面用的cvff力场

感谢您的回答，但是UFF和CVFF是不是都没有有电荷项啊，我想做吸附，是不应该根据计算去添加呢

cgy 发表于 Post on 2025-3-7 10:47:06

zzvion 发表于 2025-3-5 23:41
你的MoS2用的什么力场呢

gromacs里面用的UFF力场，materials studio里面用的cvff力场

zzvion 发表于 Post on 2025-3-5 23:41:40

你的MoS2用的什么力场呢

sobereva 发表于 Post on 2024-12-8 03:11:22

cgy 发表于 2024-12-7 09:51
请问老师谐振势是从itp文件里手动添加吗，还是通过其他软件可以得出，比如cp2k，vasp等，请老师赐教。

是

cgy 发表于 Post on 2024-12-7 09:51:27

sobereva 发表于 2024-12-7 04:55
每层MoS2之间的边角的原子间加上适当的谐振势实现绑住

请问老师谐振势是从itp文件里手动添加吗，还是通过其他软件可以得出，比如cp2k，vasp等，请老师赐教。

sobereva 发表于 Post on 2024-12-7 04:55:44

每层MoS2之间的边角的原子间加上适当的谐振势实现绑住

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