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使用Gaussian计算花菁染料吸收光谱差距过大,求助寻找原因

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发布时间: 2024-12-6 20:51

正文摘要:

阅读老师计算吸收波长的推文后(http://sobereva.com/314)使用Gaussian计算染料的吸收波长,但是计算结果与实验测试结果有较大的出入。 我一共计算了两种花菁染料(Cy3、Cy5),其吸收波长分别为550nm和650nm ...

回复 Reply

sobereva 发表于 Post on 2024-12-7 04:59:55
大志 发表于 2024-12-6 20:53
重新发送Cy3的吸收光谱

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。

那叫博文,不叫推文

尝试w调控的泛函
优化长程校正泛函w参数的简便工具optDFTw
http://sobereva.com/346http://bbs.keinsci.com/thread-4100-1-1.html
如果也明显高估,大概率是双激发特征不可忽视,对这种不小的体系可以尝试做ADC(2)计算,见https://doi.org/10.1002/qua.25780里的讨论。
大志 发表于 Post on 2024-12-7 22:24:55
wal 发表于 2024-12-7 11:31
对于cy7这样的体系我最高算到过10,够用
具体算到多少你自己决定吧 反正多算多少都不是错误 只是多消耗 ...

好的,感谢老师。
wal 发表于 Post on 2024-12-7 11:31:51
大志 发表于 2024-12-7 10:12
是的老师,确实是我没有表述清楚,我需要对比的一系列染料其中最大吸收最长可以到1200nm左右,那我应该设 ...

对于cy7这样的体系我最高算到过10,够用
具体算到多少你自己决定吧 反正多算多少都不是错误 只是多消耗计算资源的问题
大志 发表于 Post on 2024-12-7 10:12:38
wal 发表于 2024-12-7 09:15
要跟阴离子对比 那加弥散是没错(这种事应该主动在帖子里提出来)
但是我依然怀疑n=50的必要性..毕竟关注 ...

是的老师,确实是我没有表述清楚,我需要对比的一系列染料其中最大吸收最长可以到1200nm左右,那我应该设置nstates等于多少呢?我都改成了30,这样可以吗?
wal 发表于 Post on 2024-12-7 09:15:09
大志 发表于 2024-12-7 08:41
感谢老师的指导,这两个确实不用nstates=50和弥散,我也发现了。我计算么多是因为后面要将这些数据与我的 ...

要跟阴离子对比 那加弥散是没错(这种事应该主动在帖子里提出来)
但是我依然怀疑n=50的必要性..毕竟关注的一般都是第一激发 这种小分子算50个估计都算到100nm了吧
大志 发表于 Post on 2024-12-7 08:47:32
sobereva 发表于 2024-12-7 04:59
有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员 ...

收到,感谢社长的纠错与指导,感谢。
大志 发表于 Post on 2024-12-7 08:43:24
lemon_electron 发表于 2024-12-7 00:32
6-31G系列至少得加个*,这个没问题,nstates确实没必要算太多,10个应该就可以

感谢老师指导,确实不用算这莫多。
大志 发表于 Post on 2024-12-7 08:41:54
wal 发表于 2024-12-6 22:03
普通泛函这个误差见怪不怪了,我也日常蓝移100nm,想再对准一点可以试试DSD-PBEP86或者B2PLYP-D3这种双杂化 ...

感谢老师的指导,这两个确实不用nstates=50和弥散,我也发现了。我计算么多是因为后面要将这些数据与我的阴离子二区染料做对比,这样的话是不是应当要使用相同的计算方法。
cokie 发表于 Post on 2024-12-7 01:33:58
花菁类染料具有部分双电子激发特征,普通泛函算激发自然算不准,就算凑巧准了也是误差抵消的结果。
最简单的方法是采用ORCA里的ADC2方法算激发(准确度随不高但够用)
lemon_electron 发表于 Post on 2024-12-7 00:32:46
6-31G系列至少得加个*,这个没问题,nstates确实没必要算太多,10个应该就可以
wal 发表于 Post on 2024-12-6 22:03:00
本帖最后由 wal 于 2024-12-6 22:12 编辑

普通泛函这个误差见怪不怪了,我也日常蓝移100nm,想再对准一点可以试试DSD-PBEP86或者B2PLYP-D3这种双杂化
才看见你加了弥散 这个没必要 当前体系没负电荷 把zeta数提上去更有利于算准
肩峰要算个振动分辨光谱才能产生,直接垂直激发是不会有精细结构的
nstates=50没必要吧..这种小分子算到5都差不多了

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