各位老师好，请教distance_restraints报错的问题，谢谢老师

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cgy

发布时间: 2024-12-9 11:51

本帖最后由 cgy 于 2024-12-10 11:43 编辑各位老师好，在学习了论坛中关于距离限制的帖子后，我也对同一分子下的三层二硫化钼纳米片的边缘原子进行距离限制以使纳米片不跑散，但总报错如下 ERROR 1 ...

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cgy 发表于 Post on 2024-12-12 11:38:02

sobereva 发表于 2024-12-11 02:26
反复尝试加的位点以及加的数目、不同的力常数

已解决，重新生成了一遍top文件和gro文件后再加上之前的bonds限制就不散了，谢谢老师

sobereva 发表于 Post on 2024-12-11 02:26:18

cgy 发表于 2024-12-10 11:45
老师您好，在bonds项后面加了type为6的限制势之后，三层纳米片没有散，但是每层纳米片之间的键有断裂，请 ...

反复尝试加的位点以及加的数目、不同的力常数

sobereva 发表于 Post on 2024-12-10 07:49:25

用[bonds]项实现限制势，并且要写到[atoms]后头

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