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能量最小化失败,麻烦大家看一下什么原因导致的

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发布时间: 2024-12-9 17:18

正文摘要:

1、使用chemdraw构建分子结构,chem3D可视化,并保存为pdb、.mol2格式 2、GFN2-xTB优化 ,得到xtbopt.xyz,charges、 3、multiwfn计算RESP,sobtop生成拓扑文件,基于Amber GAFF 4、搭建盒子,加入25个分子,填充 ...

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milk_q 发表于 Post on 2024-12-9 18:45:28
snljty2 发表于 2024-12-9 18:32
这不是报错。如果MD后面能跑起来,就直接跑。如果不能,可以尝试用双精度版本再做一点儿能量极小化。

好的 谢谢您
snljty2 发表于 Post on 2024-12-9 18:32:24
这不是报错。如果MD后面能跑起来,就直接跑。如果不能,可以尝试用双精度版本再做一点儿能量极小化。

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