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结构优化过程CO2结合不上去

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发布时间: 2024-12-9 18:46

正文摘要:

各位老师好,我想优化一个结构,将CO2结合到Re原子上,但是始终优化会分开,是泛函基组选择的不太合适导致的么?还是这个反应过程不太对呢?请各位老师指导~ (目前尝试优化的泛函和基组有pbepbe def2svp em=gd3bj ...

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wzkchem5 发表于 Post on 2024-12-11 21:35:33
wangwei123 发表于 2024-12-10 16:11
老师,您好,我尝试加上文献所提到的乙腈溶液还是会分开(用的是IEFPCM模型,然后基组泛函是pbepbe de ...

文献说的确定是你画的这个结构的电荷为0吗,还是另一个取代基或配体不一样的结构?
wangwei123 发表于 Post on 2024-12-10 23:11:37
wzkchem5 发表于 2024-12-10 17:00
仔细看文献,充分理解文献以后再设。
文献可能没画电荷,但是充分调研这个体系其他的文献以后,应该会发 ...

老师,您好,我尝试加上文献所提到的乙腈溶液还是会分开(用的是IEFPCM模型,然后基组泛函是pbepbe def2svp 加em=gd3bj)
文献里有设定电荷,规定的这个结构就是电荷为0,很纳闷为啥结合不上去
wzkchem5 发表于 Post on 2024-12-10 17:00:34
wangwei123 发表于 2024-12-10 09:23
我优化结构设置的是 整体电荷为0,自旋多重度为2 进行的计算,但就是出现了这样的情况

仔细看文献,充分理解文献以后再设。
文献可能没画电荷,但是充分调研这个体系其他的文献以后,应该会发现反应物Re是一价。闭壳层一价Re的孤对电子亲核进攻CO2。这是很经典的体系,必须对它的电子结构有概念
wangwei123 发表于 Post on 2024-12-10 16:23:49
wzkchem5 发表于 2024-12-10 02:30
此外有可能这个反应只有在溶剂里才能发生,真空里不能发生

好呢,老师,我加溶剂模型试试
wangwei123 发表于 Post on 2024-12-10 16:23:29
dnlx 发表于 2024-12-9 23:34
我的意思就是设整体电荷,但是可以猜测铼将会是正一价。这时只有氧配位才能得到18电子构型。

我优化结构设置的是 整体电荷为0,自旋多重度为2 进行的计算,但就是出现了这样的情况
wzkchem5 发表于 Post on 2024-12-10 02:30:09
此外有可能这个反应只有在溶剂里才能发生,真空里不能发生
dnlx 发表于 Post on 2024-12-9 23:34:35
wangwei123 发表于 2024-12-9 21:31
我记得高斯只能设置整体的电荷,单独设置不了铼的化合价吧?请问您说的得到稳定氧端配位具体怎么操作实现 ...

我的意思就是设整体电荷,但是可以猜测铼将会是正一价。这时只有氧配位才能得到18电子构型。

wangwei123 发表于 Post on 2024-12-9 21:31:45
dnlx 发表于 2024-12-9 20:26
那我说的第一种情况就得把铼变成正一价,得到稳定的氧端配位。
(从你优化的结果看,配体平面往上翘,说 ...

我记得高斯只能设置整体的电荷,单独设置不了铼的化合价吧?请问您说的得到稳定氧端配位具体怎么操作实现呢?
dnlx 发表于 Post on 2024-12-9 20:26:08
wangwei123 发表于 2024-12-9 20:12
但是文献里给的这个结构是电荷为0的六元环(2-2联吡啶)

那我说的第一种情况就得把铼变成正一价,得到稳定的氧端配位。
(从你优化的结果看,配体平面往上翘,说明它们提供的配位电子数确实太多,所以CO2无法太靠近,是合理的结果)
wangwei123 发表于 Post on 2024-12-9 20:12:51
dnlx 发表于 2024-12-9 19:35
铼的外层电子数不满足18。满足的方法是,要么一个环改成五元的,氢变成奇数个,这个环的氮和铼之间是共价键 ...

但是文献里给的这个结构是电荷为0的六元环(2-2联吡啶)
dnlx 发表于 Post on 2024-12-9 19:35:14
铼的外层电子数不满足18。满足的方法是,要么一个环改成五元的,氢变成奇数个,这个环的氮和铼之间是共价键(各出一个电子),但是这时二氧化碳应该氧端配位。要么体系应该存在一个负电荷,这时才能碳和铼形成共价键。供参考。

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