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k点收敛性测试算出的每个k点能量都是0

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发布时间: 2024-12-11 11:53

正文摘要:

各位老师好,我使用cp2k将si.cif文件转化为.inp文件(泛函为PBE,基组为DZVP- MOLOPT- SR- GTH),然后将inp文件和xyz文件、kpconv.sh文件转到并行上,结果算出来的所有k点的能量都是0。我刚学习Linux系统,看不出问 ...

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alenrose 发表于 Post on 2024-12-11 13:00:39
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2024-12-11 12:57
我楼上提到的那帖从9楼开始说了超算的问题,而我也提到了使用计算集群却没有Linux基础知识的解决方法,请 ...

ok
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 Post on 2024-12-11 12:57:30
alenrose 发表于 2024-12-11 12:13
这是我提交其他作业的脚本

我楼上提到的那帖从9楼开始说了超算的问题,而我也提到了使用计算集群却没有Linux基础知识的解决方法,请先仔细看一看。

这里用的k点收敛性测试的脚本能看出来也是社长编写并在CP2K第一性原理计算培训班里提供的那个,但是仍然要提醒一下,注意正确表明出处。社长目前不用作业调度系统,他写的脚本假定了使用者是在单机Linux系统上运行CP2K,且能用$cp2k_bin或者mpirun $cp2k_bin(其他参数暂时省略)之类的命令直接启动。所以迁移到超算上使用,就得把直接启动CP2K计算的命令改成通过作业提交脚本提交CP2K任务的命令。
Freeman 发表于 Post on 2024-12-11 12:42:59
每个人写输入文件的习惯不一样, 每个平台提交任务的方式都不一样,让大家看脚本有什么用呢?应该拿一个这个脚本生成的输入文件以及报错的输出文件,让大家看有什么问题。
alenrose 发表于 Post on 2024-12-11 12:13:13
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2024-12-11 12:03
输入输出毕竟是文本文件,适当压缩后作为帖子附件上传更方便下载检查,现在这样分好多张截图实在麻烦。

...

这是我提交其他作业的脚本

sub.sh

182 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 3

这是我的提交作用成功的脚本

alenrose 发表于 Post on 2024-12-11 12:07:21
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2024-12-11 12:03
输入输出毕竟是文本文件,适当压缩后作为帖子附件上传更方便下载检查,现在这样分好多张截图实在麻烦。

...

好的 谢谢老师
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 Post on 2024-12-11 12:03:58
输入输出毕竟是文本文件,适当压缩后作为帖子附件上传更方便下载检查,现在这样分好多张截图实在麻烦。

运行CP2K的系统是有作业调度系统的超算吗,有没有先前提交作业成功跑CP2K的脚本?

这帖的问题和我回答过的http://bbs.keinsci.com/thread-50259-1-1.html类似,也可参考一下。

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