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计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 分子模拟 (Molecular Modeling) › 使用gmx计算聚合物拉伸的问题

使用gmx计算聚合物拉伸的问题

查看数: 707 | 评论数: 2 | 收藏 Add to favorites 0

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发布时间: 2024-12-14 12:24

正文摘要:

尝试通过gmx中的deform参数模拟聚合物的拉伸过程；在完成NPT后(图1)将参数设置为如下所示以实现Y轴方向拉伸： pcoupl = Berendsen pcoupltype & ...

回复 Reply

liuxdhs 发表于 Post on 2024-12-14 14:12:44

查看初始box的密度是多少，看看弛豫效果如何。
另外，deform的速率可以适当减小。

pal 发表于 Post on 2024-12-14 14:02:00

你这个应该是将聚合物向两端拉，该做SMD

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