计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

gromacs 蛋白质itp文件与pdb文件原子数目不匹配

查看数: 394 | 评论数: 2 | 收藏 Add to favorites 0
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2024-12-24 15:08

正文摘要:

原子数目不匹配,怎末才能解决这个问题?感谢大佬帮助!

回复 Reply

reddy 发表于 Post on 2024-12-24 19:02:31
sobereva 发表于 2024-12-24 15:14
自己根据GROMACS的常识反复检查[molecules]里的信息(分子种类、分子数)和结构文件的对应关系
另外,不推 ...

好的,老师,我在改改
sobereva 发表于 Post on 2024-12-24 15:14:07
自己根据GROMACS的常识反复检查[molecules]里的信息(分子种类、分子数)和结构文件的对应关系
另外,不推荐用OPLS-AA模拟蛋白质,毫无好处。我最推荐用AMBER系力场

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-1-25 07:10 , Processed in 0.182156 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list