求助计算Cu-HHTP电催化实验过程中，混合基组的使用范围

查看数: 636 | 评论数: 9 | 收藏 Add to favorites 0

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

发布时间: 2024-12-25 07:13

本帖最后由 2877321934 于 2024-12-25 07:17 编辑新接了个帮实验组计算电催化过程的课题，目前不考虑使用CP2K或者VASP进行计算，只考虑Gaussian或者ORCA，翻阅了下文献发现如下图的模型是能够充分模拟体系的 ...

回复 Reply

2877321934 发表于 Post on 2025-1-28 08:49:42

LetsQu1t 发表于 2025-1-27 07:37
用简化的小体系做探索性计算是很常见的做法。另外以你的计算资源算这个体系没太大压力。3-21G实在是太小了 ...

谢谢回复。

2877321934 发表于 Post on 2025-1-28 08:49:31

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-1-27 11:16
原始结构的羟基毕竟和苯环共轭，在氧化还原中很可能配体也要参与得失电子（所谓non-innocent ligand）， ...

不是电中性，整体电荷设置的-2，谢谢老师的建议，计划采纳。

2877321934 发表于 Post on 2025-1-28 08:48:21

sobereva 发表于 2025-1-27 13:59
你的体系没什么柔性，根本不需要构象搜索
你的简化方式过激了。pi共轭是长程的而不是像sigma键那样定域 ...

谢谢老师的回复，我主要想做构象搜索的是吸附上去的反应符合物，谢谢指导，打算两边加个苯环当简化模型了。

sobereva 发表于 Post on 2025-1-27 13:59:43

2877321934 发表于 2025-1-27 05:58
补充请教老师一个问题，由于这个体系较大，做反应物的复合物构象搜索或者找反应过程过渡态之类的较耗时， ...

你的体系没什么柔性，根本不需要构象搜索
你的简化方式过激了。pi共轭是长程的而不是像sigma键那样定域的，不能截得如此之多，不重要的区域用小基组倒是可以用来节约耗时。

Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 Post on 2025-1-27 11:16:59

2877321934 发表于 2025-1-27 05:58
补充请教老师一个问题，由于这个体系较大，做反应物的复合物构象搜索或者找反应过程过渡态之类的较耗时， ...

原始结构的羟基毕竟和苯环共轭，在氧化还原中很可能配体也要参与得失电子（所谓non-innocent ligand），简化模型至少也要用类似邻苯二酚的结构才合适，现在这个类似乙二醇的结构太小了。另外如果四个羟基的氢全部电离、结构整体为电中性的话，铜成了四价似乎也有点高。

LetsQu1t 发表于 Post on 2025-1-27 07:37:41

用简化的小体系做探索性计算是很常见的做法。另外以你的计算资源算这个体系没太大压力。3-21G实在是太小了，能节约的时间其实也有限。建议还是统一使用def2-SVP。

2877321934 发表于 Post on 2024-12-25 07:49:56

sobereva 发表于 2024-12-25 07:37
你这个体系有高对称性，Gaussian利用对称性在56核机子上算起来没有多贵，你那种做法可以，但没有多大必要

好的，谢谢老师哈

sobereva 发表于 Post on 2024-12-25 07:37:29

你这个体系有高对称性，Gaussian利用对称性在56核机子上算起来没有多贵，你那种做法可以，但没有多大必要

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register