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求助,gromacs模拟离子液体性质计算和实验数据相差过大

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发布时间: 2024-12-25 21:18

正文摘要:

本帖最后由 zfy524 于 2024-12-25 21:22 编辑 各位老师好,我用gromacs模拟了离子液体的密度和静态介电常数,和实验值相差过大。 我的计算步骤是, 1.先用Gaussian(b3lyp/def2tzvp)计算RESP2原子电荷结合sobt ...

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zfy524 发表于 Post on 2024-12-28 10:54:42
本帖最后由 zfy524 于 2024-12-28 11:12 编辑
sobereva 发表于 2024-12-25 22:05
建议你先尝试重复J. Phys. Chem. B, 119,, 5882 (2015)里面GAFF算离子液体的数据,以便通过对比定位原因

谢谢sob老师,
我用您提供的这篇文献中的方法算了一下,结果相差还是很大。
使用gmx current计算出来的epsilon=3270.355469,而用gmx dipoles计算出来的epsilon=3.34749
这两种方法有什么区别呢,dipoles计算出来的更接近文献中的报道11.5。
另外在这篇帖子中的同学也遇到类似的问题:两种计算静态介电常数的方法结果不一致? - 分子模拟 (Molecular Modeling) - 计算化学公社
他们提到 gmx current 计算得到的 dielectric constant using EH 项与实验值相近,我得出的值为7.0534,这个值是否能用呢?
谢谢sob老师的解答
sobereva 发表于 Post on 2024-12-25 22:05:56
建议你先尝试重复J. Phys. Chem. B, 119,, 5882 (2015)里面GAFF算离子液体的数据,以便通过对比定位原因

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