gmx sasa或者VMD都可以对特定的部分计算溶剂可及表面积(SASA),形状不限。结果除以2可当做膜面积(但我不确信对周期边界处是怎么考虑的,可以测试,如果发现没考虑周期性,可以把变形时的SASA相对于非变形时的SASA的差值加到非变形时的XY面积上作为变形时的膜面积) |
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