求助：使用学校计算平台跑动力学模拟什么情况会终止

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x^x

发布时间: 2024-12-30 22:00

本帖最后由 x^x 于 2024-12-30 22:09 编辑各位老师好。我在学校高性能计算平台gromacs2020.3中提交了一个平衡相的动力学模拟，总共设置1ns，步长为0.001。具体模型为固体层-液体层- ...

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chenym 发表于 Post on 2025-1-2 10:56:02

x^x 发表于 2025-1-1 21:30
感谢您的回复，祝您元旦快乐！
在计算平台上，我提交任务用的脚本文件参考自平台上给出的示例，当脚本文 ...

这个是服务器的计算设置脚本，这一行是你所使用的节点设置，每个服务器的总节点数不一样，然后N和n设置不同会影响并行任务的数量，从而影响计算速度，你可以查一下节点设置来提高计算速度，我的计算出现错误就会停止，模拟完设置步长也会停止，报错会出现在输出的log文件中，也可以用取消计算命令来停止。

student0618 发表于 Post on 2024-12-30 23:35:50

模拟中一般都可以查看log文件看跑到哪

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