计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

amber导入小分子力场时出错

查看数: 8307 | 评论数: 2 | 收藏 Add to favorites 1
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2017-2-21 09:07

正文摘要:

1、我在用amber导入蛋白质的时候先导入了小分子的.prep  .frcmod文件,然后在导入蛋白质的时候出现了这样的错误,并且跳出了tleap。这是怎么回事呢?请老师帮一下忙,谢谢了。2、是因为原子类型不一致吗? ...

回复 Reply

现在就好 发表于 Post on 2017-2-21 16:27:04
abdoman 发表于 2017-2-21 11:41
应该是你pdb文件,与分子参数文件prep 文件,分子顺序不一致吧。

这样啊   谢谢您  那应该怎样改呢?对照着prep文件把我的pdb文件整个都调成与prep文件一致的原子顺序吗?
abdoman 发表于 Post on 2017-2-21 11:41:13
应该是你pdb文件,与分子参数文件prep 文件,分子顺序不一致吧。

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +1 收起 理由
Reason
sobereva + 1

查看全部评分 View all ratings

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 16:38 , Processed in 0.330036 second(s), 27 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list