直接上传mdp文件
否则倘若有隐藏字符别人也看不出来

lucky1999 发表于 2025-1-8 15:45
图里说了，检查ions.mdp中第一行

我是按照官网下载的，这个是有什么问题吗
; LINES STARTING WITH ';' ARE COMMENTS
title                           = Minimization        ; Title of run

; Parameters describing what to do, when to stop and what to save
integrator            = steep                ; Algorithm (steep = steepest descent minimization)
emtol                    = 1000.0          ; Stop minimization when the maximum force < 10.0 kJ/mol
emstep          = 0.01      ; Energy step size
nsteps                    = 50000                  ; Maximum number of (minimization) steps to perform

; Parameters describing how to find the neighbors of each atom and how to calculate the interactions
nstlist                    = 1                    ; Frequency to update the neighbor list and long range forces
cutoff-scheme   = Verlet
ns_type                    = grid                ; Method to determine neighbor list (simple, grid)
rlist                    = 1.0                ; Cut-off for making neighbor list (short range forces)
coulombtype            = cutoff        ; Treatment of long range electrostatic interactions
rcoulomb            = 1.0                ; long range electrostatic cut-off
rvdw                    = 1.0                ; long range Van der Waals cut-off
pbc             = xyz                 ; Periodic Boundary Conditions

图里说了，检查ions.mdp中第一行